Marco Huaco se ha desempeñado en el ámbito público y privado en su calidad de especialista jurídico y como analista político.
Es profesor del Instituto Latinoamericano de Ciencias Sociales en los Diplomados de Políticas Públicas con Enfoque Basado en Derechos Humanos; Gestión Pública Intercultural; Educación Intercultural y Políticas Públicas; Políticas Interculturales Sectoriales; Derechos Comunitarios y Proyectos Extractivos; Derechos Indígenas en el Sistema Universal de la ONU; Conflictos Sociales y Convenio 169 de la OIT; Derechos Indígenas en el Sistema Interamericano de DDHH, temas que también desarrolla en la institución de la que es fundador (el Centro de Capacitaciones e Investigaciones Estratégicas).
Se ha desempeñado como asesor parlamentario de Congresistas de izquierda en los periodos 2011-2013 y luego 2016-2019 en estrategias político-parlamentarias, elaboración de proyectos y dictámenes de medidas legislativas, asuntos indígenas, ambientales, interculturales, derechos humanos y culturales.
Ha desarrollado diversas capacitaciones junto a la Escuela Mayor de Gestión Municipal en Programas de formación de formadores, para líderes de comunidades indígenas nativas en la Selva Central en habilidades blandas y gestión de proyectos comunitarios, y consultor de organizaciones de la sociedad civil nacional e internacional tales como la Sociedad Peruana de Derecho Ambiental (Perú), la Indian Law Ressource Center (EEUU), Oxfam International (Guatemala), WWF, CEAS, Perú Equidad, Earth Rights International, etc., etc. así como en el ámbito de la acción social y de desarrollo (ADRA Perú, años 200-2007) y de las libertades de religión y de conciencia para diversas comunidades religiosas en Perú y en otros países latinoamericanos.
Se ha desempeñado como Oficial de Políticas Públicas en el Proyecto SEMILLA impulsando políticas públicas nacionales y regionales para la erradicación y prevención del trabajo infantil peligroso en el ámbito rural e indígena, como asesor jurídico y político de organizaciones indígenas peruanas tales como la Organización para el Desarrollo de las Comunidades Fronterizas del Cenepa (ODECOFROC), el Gobierno Territorial Wampís, AIDESEP, etc., y de organizaciones indígenas internacionales como la CONAMAQ y la CAOI.
Su labor de activista a favor del Estado laico y la libertad de conciencia, lo ha llevado a participar como expositor y consultor para los procesos de Asambleas Constituyentes de Bolivia (2007) y de Ecuador (2008).