Marco Huaco se ha desempeñado en el ámbito público y privado en su calidad de académico, docente, asesor jurídico y político.
Actualmente es Presidente Fundador del Centro de Capacitaciones e Investigaciones Estratégicas, institución desde la cual desarrolla programas de capacitación dirigidos a profesionales y líderes sociales en los ámbitos de las Políticas Públicas con Enfoque Basado en Derechos Humanos (EBDH), gestión pública intercultural, políticas públicas interculturales, derechos comunitarios y proyectos extractivos; derechos indígenas y afrodescendientes en el Sistema Universal de la ONU, del Convenio 169 de la OIT y del Sistema Interamericano de derechos humanos.
Se ha desempeñado como asesor parlamentario en los periodos 2011-2013 y luego 2016-2019, destacando en estrategias político-parlamentarias, elaboración de proyectos y dictámenes de medidas legislativas.
Ha desarrollado numerosas capacitaciones junto a la Escuela Mayor de Gestión Municipal en Programas de formación de formadores, para líderes de comunidades indígenas nativas en la Selva Central en habilidades blandas y gestión de proyectos comunitarios, y consultor de organizaciones de la sociedad civil nacional e internacional tales como la Sociedad Peruana de Derecho Ambiental (Perú), la Indian Law Ressource Center (EEUU), Oxfam International (Guatemala), WWF, CEAS, Perú Equidad, Earth Rights International, etc., etc. así como en el ámbito de la acción social y de desarrollo (ADRA Perú, años 200-2007) y de las libertades de religión y de conciencia para diversas comunidades religiosas en Perú y en otros países latinoamericanos.
También se ha desempeñado como Oficial de Políticas Públicas en el Proyecto SEMILLA impulsando políticas públicas nacionales y regionales para la erradicación y prevención del trabajo infantil peligroso en el ámbito rural e indígena, como asesor jurídico y político de organizaciones indígenas peruanas tales como la Organización para el Desarrollo de las Comunidades Fronterizas del Cenepa (ODECOFROC), el Gobierno Territorial Wampís, AIDESEP, etc., y de organizaciones indígenas internacionales como la CONAMAQ y la CAOI.
Su labor de activista académico a favor del Estado laico y la libertad de religión y de conciencia, lo ha llevado a participar como expositor y consultor internacional ante diversas Universidades e incluso en los procesos Constituyentes de Bolivia (2007) y de Ecuador (2008).